Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLIP2Q9UDT6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLIP2Q9UDT6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms