Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LHX9Q9NQ69 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms