Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q9CQC3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q9CQC3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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