Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Atl3Q91YH5 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atl3Q91YH5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms