Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zbed4Q80WQ9 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms