Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SobpQ0P5V2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms