Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkchP23298 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PrkchP23298 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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