Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
P18528 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
P18528 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
P18528 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms