Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.7 ms