Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CCDC175P0C221 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms