Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEFMP07197 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEFMP07197 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEFMP07197 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NEFMP07197 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEFMP07197 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEFMP07197 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEFMP07197 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms