Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01789 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01789 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01789 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms