Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Csnk2a2O54833 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms