Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Atp8b5A3FIN4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atp8b5A3FIN4 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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