Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KLHL28Q9NXS3 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KLHL28Q9NXS3 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms