Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tmco5aQ9D9D5 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmco5aQ9D9D5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms