Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tdrd12Q9CWU0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms