Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rab5aQ9CQD1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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