Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gga3Q8BMI3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms