Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GypcQ78HU7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms