Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXZ0

TMIGD1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD1Q6UXZ0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMIGD1Q6UXZ0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMIGD1Q6UXZ0 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms