Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtifQ6PEE2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtifQ6PEE2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms