Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf40Q3U319 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rnf40Q3U319 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf40Q3U319 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf40Q3U319 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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