Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Cxcr5Q04683 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Cxcr5Q04683 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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