Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Cldn18P56857 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn18P56857 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
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