Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GFRA1P56159 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GFRA1P56159 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms