Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc94Q9D6J3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms