Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttll4Q80UG8 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms