Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Tmem253Q3UNB8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Tmem253Q3UNB8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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