Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMC1AQ14683 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMC1AQ14683 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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