Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CYP4F3Q08477 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms