Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LtbrP50284 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LtbrP50284 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms