Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxd4P10628 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms