Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vstm4T1NXB5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vstm4T1NXB5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vstm4T1NXB5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vstm4T1NXB5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms