Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Top3bQ9Z321 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Top3bQ9Z321 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Top3bQ9Z321 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Top3bQ9Z321 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top3bQ9Z321 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms