Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Thbs4Q9Z1T2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Thbs4Q9Z1T2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Thbs4Q9Z1T2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms