Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUE3

Cyb561d2, Cytochrome b561 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d2Q9WUE3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cyb561d2Q9WUE3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyb561d2Q9WUE3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cyb561d2Q9WUE3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cyb561d2Q9WUE3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms