Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pfdn5Q9WU28 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pfdn5Q9WU28 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pfdn5Q9WU28 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms