Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb3Q9R1P1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Psmb3Q9R1P1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Psmb3Q9R1P1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms