Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Slit2Q9R1B9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Slit2Q9R1B9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Slit2Q9R1B9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Slit2Q9R1B9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Slit2Q9R1B9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slit2Q9R1B9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slit2Q9R1B9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slit2Q9R1B9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Slit2Q9R1B9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Slit2Q9R1B9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms