Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M4

Podxl, Podocalyxin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodxlQ9R0M4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PodxlQ9R0M4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PodxlQ9R0M4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PodxlQ9R0M4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PodxlQ9R0M4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms