Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L6

Pcm1, Pericentriolar material 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcm1Q9R0L6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pcm1Q9R0L6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pcm1Q9R0L6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcm1Q9R0L6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms