Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg1Q9QZE5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg1Q9QZE5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg1Q9QZE5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg1Q9QZE5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg1Q9QZE5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg1Q9QZE5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg1Q9QZE5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Copg1Q9QZE5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Copg1Q9QZE5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Copg1Q9QZE5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Copg1Q9QZE5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms