Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ercc4Q9QZD4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ercc4Q9QZD4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ercc4Q9QZD4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ercc4Q9QZD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms