Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VapbQ9QY76 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
VapbQ9QY76 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VapbQ9QY76 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms