Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tgm1Q9JLF6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tgm1Q9JLF6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Tgm1Q9JLF6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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