Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pard6bQ9JK83 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pard6bQ9JK83 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pard6bQ9JK83 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pard6bQ9JK83 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms