Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ascl3Q9JJR7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ascl3Q9JJR7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ascl3Q9JJR7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ascl3Q9JJR7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms