Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Smad9Q9JIW5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Smad9Q9JIW5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Smad9Q9JIW5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Smad9Q9JIW5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms