Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Riok3Q9DBU3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Riok3Q9DBU3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Riok3Q9DBU3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Riok3Q9DBU3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms